Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P58686 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P58686 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P58686 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P58686 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P58686 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P58686 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P58686 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P58686 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P58686 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P58686 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P58686 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P58686 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P58686 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P58686 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P58686 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P58686 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P58686 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P58686 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P58686 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P58686 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P58686 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P58686 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P58686 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P58686 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P58686 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P58686 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P58686 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P58686 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P58686 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P58686 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P58686 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P58686 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P58686 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P58686 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P58686 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P58686 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P58686 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
P58686 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P58686 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P58686 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P58686 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P58686 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P58686 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P58686 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P58686 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
P58686 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P58686 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P58686 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P58686 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P58686 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
P58686 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P58686 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P58686 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P58686 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P58686 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P58686 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
P58686 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P58686 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P58686 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P58686 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
P58686 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P58686 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P58686 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P58686 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
P58686 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
P58686 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
P58686 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P58686 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P58686 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P58686 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P58686 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P58686 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P58686 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
P58686 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P58686 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
P58686 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
P58686 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P58686 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
P58686 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P58686 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P58686 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
P58686 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P58686 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
P58686 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
P58686 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
P58686 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
P58686 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
P58686 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
P58686 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
P58686 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms