Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Samsn1P57725 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Samsn1P57725 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samsn1P57725 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samsn1P57725 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samsn1P57725 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms