Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mc4rP56450 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mc4rP56450 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mc4rP56450 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mc4rP56450 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mc4rP56450 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms