Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aqp4P55088 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aqp4P55088 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aqp4P55088 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aqp4P55088 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms