Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp1P52624 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upp1P52624 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upp1P52624 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Upp1P52624 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upp1P52624 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp1P52624 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Upp1P52624 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp1P52624 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upp1P52624 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upp1P52624 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upp1P52624 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upp1P52624 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Upp1P52624 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms