Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr1cP52432 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Polr1cP52432 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr1cP52432 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms