Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa11P50709 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa11P50709 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa11P50709 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa11P50709 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa11P50709 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa11P50709 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa11P50709 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa11P50709 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa11P50709 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa11P50709 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa11P50709 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa11P50709 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa11P50709 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms