Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Pa2g4P50580 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pa2g4P50580 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pa2g4P50580 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Pa2g4P50580 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pa2g4P50580 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pa2g4P50580 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pa2g4P50580 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pa2g4P50580 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pa2g4P50580 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms