Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CtshP49935 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CtshP49935 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CtshP49935 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CtshP49935 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CtshP49935 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CtshP49935 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CtshP49935 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CtshP49935 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CtshP49935 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CtshP49935 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtshP49935 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtshP49935 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtshP49935 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtshP49935 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtshP49935 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtshP49935 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CtshP49935 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CtshP49935 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CtshP49935 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CtshP49935 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CtshP49935 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CtshP49935 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CtshP49935 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CtshP49935 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CtshP49935 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CtshP49935 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CtshP49935 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CtshP49935 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CtshP49935 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CtshP49935 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CtshP49935 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtshP49935 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtshP49935 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtshP49935 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtshP49935 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CtshP49935 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CtshP49935 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CtshP49935 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CtshP49935 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CtshP49935 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CtshP49935 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CtshP49935 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtshP49935 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtshP49935 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtshP49935 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtshP49935 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtshP49935 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtshP49935 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtshP49935 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CtshP49935 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CtshP49935 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CtshP49935 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CtshP49935 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CtshP49935 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtshP49935 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtshP49935 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtshP49935 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtshP49935 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtshP49935 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtshP49935 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtshP49935 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtshP49935 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CtshP49935 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CtshP49935 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CtshP49935 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CtshP49935 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CtshP49935 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtshP49935 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtshP49935 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtshP49935 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CtshP49935 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtshP49935 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtshP49935 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtshP49935 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtshP49935 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CtshP49935 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CtshP49935 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CtshP49935 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CtshP49935 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CtshP49935 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CtshP49935 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CtshP49935 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CtshP49935 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CtshP49935 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CtshP49935 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CtshP49935 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CtshP49935 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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