Protein–RNA interactions for Protein: P49117

Nr2c2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2c2P49117 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr2c2P49117 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2c2P49117 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2c2P49117 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2c2P49117 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms