Protein–RNA interactions for Protein: P48722

Hspa4l, Heat shock 70 kDa protein 4L, mousemouse

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa4lP48722 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hspa4lP48722 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hspa4lP48722 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hspa4lP48722 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hspa4lP48722 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hspa4lP48722 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hspa4lP48722 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hspa4lP48722 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hspa4lP48722 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hspa4lP48722 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hspa4lP48722 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms