Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfkmP47857 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PfkmP47857 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PfkmP47857 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PfkmP47857 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfkmP47857 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfkmP47857 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PfkmP47857 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PfkmP47857 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PfkmP47857 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PfkmP47857 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PfkmP47857 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PfkmP47857 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PfkmP47857 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PfkmP47857 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms