Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Kdm5cP41230 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5cP41230 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5cP41230 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5cP41230 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Kdm5cP41230 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms