Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifnar1P33896 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ifnar1P33896 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifnar1P33896 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifnar1P33896 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnar1P33896 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms