Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cbx2P30658 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cbx2P30658 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx2P30658 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx2P30658 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms