Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept4P28661 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept4P28661 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sept4P28661 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sept4P28661 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sept4P28661 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept4P28661 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept4P28661 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sept4P28661 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept4P28661 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept4P28661 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sept4P28661 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sept4P28661 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept4P28661 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept4P28661 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sept4P28661 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sept4P28661 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms