Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BrafP28028 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BrafP28028 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BrafP28028 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BrafP28028 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BrafP28028 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BrafP28028 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BrafP28028 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BrafP28028 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BrafP28028 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BrafP28028 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BrafP28028 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BrafP28028 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BrafP28028 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BrafP28028 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BrafP28028 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BrafP28028 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BrafP28028 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BrafP28028 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BrafP28028 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BrafP28028 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BrafP28028 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BrafP28028 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BrafP28028 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BrafP28028 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BrafP28028 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BrafP28028 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BrafP28028 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BrafP28028 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BrafP28028 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BrafP28028 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BrafP28028 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BrafP28028 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BrafP28028 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BrafP28028 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BrafP28028 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BrafP28028 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BrafP28028 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BrafP28028 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BrafP28028 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BrafP28028 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BrafP28028 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BrafP28028 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
BrafP28028 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BrafP28028 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BrafP28028 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BrafP28028 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BrafP28028 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BrafP28028 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BrafP28028 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BrafP28028 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BrafP28028 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BrafP28028 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BrafP28028 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BrafP28028 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BrafP28028 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BrafP28028 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BrafP28028 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BrafP28028 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BrafP28028 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BrafP28028 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BrafP28028 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BrafP28028 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BrafP28028 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BrafP28028 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BrafP28028 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BrafP28028 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BrafP28028 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BrafP28028 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BrafP28028 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BrafP28028 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BrafP28028 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BrafP28028 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BrafP28028 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BrafP28028 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BrafP28028 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BrafP28028 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BrafP28028 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BrafP28028 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BrafP28028 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BrafP28028 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms