Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou2f1P25425 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou2f1P25425 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pou2f1P25425 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pou2f1P25425 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms