Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmbsP22907 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmbsP22907 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmbsP22907 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmbsP22907 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmbsP22907 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmbsP22907 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmbsP22907 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmbsP22907 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmbsP22907 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmbsP22907 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmbsP22907 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmbsP22907 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms