Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gna11P21278 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gna11P21278 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gna11P21278 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gna11P21278 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gna11P21278 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gna11P21278 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gna11P21278 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gna11P21278 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gna11P21278 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gna11P21278 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gna11P21278 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gna11P21278 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gna11P21278 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gna11P21278 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gna11P21278 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gna11P21278 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms