Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lsp1P19973 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lsp1P19973 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsp1P19973 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms