Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsdP18242 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsdP18242 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsdP18242 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsdP18242 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsdP18242 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsdP18242 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsdP18242 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsdP18242 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsdP18242 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsdP18242 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsdP18242 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CtsdP18242 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsdP18242 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsdP18242 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsdP18242 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsdP18242 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsdP18242 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsdP18242 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsdP18242 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsdP18242 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsdP18242 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsdP18242 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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