Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ass1P16460 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ass1P16460 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ass1P16460 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ass1P16460 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ass1P16460 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ass1P16460 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ass1P16460 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ass1P16460 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ass1P16460 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ass1P16460 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ass1P16460 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ass1P16460 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ass1P16460 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ass1P16460 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ass1P16460 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms