Protein–RNA interactions for Protein: P15702

Spn, Leukosialin, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpnP15702 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpnP15702 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpnP15702 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SpnP15702 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SpnP15702 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SpnP15702 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SpnP15702 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SpnP15702 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SpnP15702 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpnP15702 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpnP15702 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpnP15702 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpnP15702 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SpnP15702 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SpnP15702 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SpnP15702 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SpnP15702 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SpnP15702 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SpnP15702 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SpnP15702 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SpnP15702 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpnP15702 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpnP15702 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpnP15702 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpnP15702 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpnP15702 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpnP15702 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpnP15702 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpnP15702 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SpnP15702 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpnP15702 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpnP15702 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpnP15702 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpnP15702 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpnP15702 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SpnP15702 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpnP15702 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpnP15702 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpnP15702 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SpnP15702 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpnP15702 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpnP15702 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpnP15702 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpnP15702 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpnP15702 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpnP15702 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SpnP15702 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpnP15702 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SpnP15702 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpnP15702 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpnP15702 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SpnP15702 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SpnP15702 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SpnP15702 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpnP15702 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpnP15702 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpnP15702 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpnP15702 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SpnP15702 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpnP15702 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpnP15702 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpnP15702 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpnP15702 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpnP15702 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpnP15702 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpnP15702 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SpnP15702 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpnP15702 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpnP15702 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpnP15702 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpnP15702 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpnP15702 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpnP15702 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpnP15702 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpnP15702 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpnP15702 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpnP15702 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpnP15702 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpnP15702 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpnP15702 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpnP15702 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpnP15702 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpnP15702 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpnP15702 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpnP15702 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpnP15702 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpnP15702 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpnP15702 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SpnP15702 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpnP15702 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpnP15702 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpnP15702 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpnP15702 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpnP15702 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpnP15702 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SpnP15702 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpnP15702 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SpnP15702 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpnP15702 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpnP15702 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms