Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa1P11477 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa1P11477 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa1P11477 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa1P11477 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa1P11477 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa1P11477 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa1P11477 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa1P11477 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa1P11477 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa1P11477 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa1P11477 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa1P11477 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms