Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna6P07350 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna6P07350 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna6P07350 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna6P07350 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifna6P07350 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifna6P07350 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna6P07350 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifna6P07350 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna6P07350 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms