Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06334 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06334 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P06334 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06334 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06334 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06334 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06334 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06334 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06334 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06334 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06334 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06334 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06334 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06334 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06334 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06334 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06334 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06334 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06334 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06334 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06334 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06334 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06334 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06334 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06334 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06334 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06334 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06334 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06334 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06334 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06334 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06334 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06334 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06334 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06334 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06334 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06334 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P06334 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06334 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06334 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06334 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06334 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06334 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06334 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06334 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06334 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06334 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06334 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06334 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06334 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06334 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06334 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06334 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06334 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06334 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06334 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06334 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06334 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06334 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06334 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06334 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms