Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrygdP04342 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrygdP04342 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CrygdP04342 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrygdP04342 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CrygdP04342 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrygdP04342 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrygdP04342 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrygdP04342 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrygdP04342 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms