Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lamc1P02468 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lamc1P02468 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lamc1P02468 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lamc1P02468 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lamc1P02468 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lamc1P02468 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms