Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col4a1P02463 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col4a1P02463 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a1P02463 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col4a1P02463 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms