Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01738 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01738 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01738 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01738 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01738 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01738 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01738 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01738 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01738 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01738 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01738 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01738 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01738 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01738 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01738 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01738 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01738 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01738 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01738 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01738 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01738 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01738 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01738 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01738 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01738 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01738 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01738 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01738 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01738 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01738 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01738 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01738 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01738 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01738 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01738 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01738 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01738 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01738 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01738 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01738 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01738 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01738 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01738 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01738 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01738 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01738 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01738 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01738 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01738 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01738 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01738 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01738 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01738 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01738 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01738 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01738 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01738 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01738 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01738 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01738 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01738 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01738 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01738 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01738 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01738 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01738 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01738 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01738 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01738 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01738 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01738 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01738 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01738 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01738 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01738 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01738 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1074.1 ms