Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01669 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01669 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01669 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01669 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01669 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01669 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01669 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01669 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01669 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01669 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01669 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01669 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01669 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01669 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P01669 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01669 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01669 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01669 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01669 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01669 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01669 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01669 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01669 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
P01669 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
P01669 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01669 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01669 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01669 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
P01669 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01669 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01669 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01669 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01669 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01669 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01669 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01669 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01669 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01669 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01669 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01669 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01669 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01669 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01669 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01669 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01669 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01669 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01669 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01669 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01669 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01669 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01669 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01669 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01669 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01669 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01669 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01669 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01669 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01669 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01669 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01669 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01669 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01669 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P01669 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01669 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01669 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01669 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01669 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01669 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01669 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01669 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01669 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01669 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01669 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01669 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01669 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
P01669 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01669 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01669 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01669 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01669 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01669 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms