Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P01649 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P01649 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P01649 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P01649 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
P01649 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
P01649 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
P01649 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01649 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01649 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01649 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01649 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01649 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01649 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01649 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01649 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01649 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01649 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01649 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01649 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01649 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01649 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01649 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01649 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01649 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01649 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01649 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01649 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01649 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01649 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01649 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01649 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01649 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01649 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01649 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01649 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01649 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01649 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01649 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01649 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01649 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01649 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01649 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01649 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
P01649 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01649 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01649 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01649 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01649 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01649 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01649 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01649 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P01649 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01649 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01649 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01649 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01649 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P01649 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P01649 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P01649 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01649 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01649 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01649 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01649 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01649 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P01649 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01649 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01649 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01649 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01649 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
P01649 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01649 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P01649 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01649 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01649 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01649 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01649 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01649 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
P01649 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01649 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01649 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01649 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01649 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01649 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01649 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01649 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01649 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01649 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01649 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01649 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01649 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms