Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FosP01101 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FosP01101 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FosP01101 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FosP01101 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FosP01101 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FosP01101 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FosP01101 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FosP01101 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FosP01101 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FosP01101 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FosP01101 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FosP01101 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FosP01101 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FosP01101 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FosP01101 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FosP01101 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FosP01101 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FosP01101 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FosP01101 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FosP01101 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FosP01101 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FosP01101 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FosP01101 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FosP01101 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FosP01101 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FosP01101 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FosP01101 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FosP01101 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FosP01101 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FosP01101 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FosP01101 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FosP01101 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FosP01101 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FosP01101 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FosP01101 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FosP01101 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FosP01101 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FosP01101 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FosP01101 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FosP01101 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FosP01101 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FosP01101 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FosP01101 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FosP01101 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FosP01101 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FosP01101 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FosP01101 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FosP01101 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FosP01101 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FosP01101 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FosP01101 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FosP01101 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FosP01101 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FosP01101 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FosP01101 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FosP01101 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FosP01101 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FosP01101 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FosP01101 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FosP01101 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FosP01101 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FosP01101 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FosP01101 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FosP01101 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FosP01101 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FosP01101 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FosP01101 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FosP01101 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FosP01101 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FosP01101 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FosP01101 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FosP01101 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FosP01101 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FosP01101 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FosP01101 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FosP01101 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FosP01101 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FosP01101 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FosP01101 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FosP01101 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FosP01101 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FosP01101 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FosP01101 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FosP01101 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FosP01101 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FosP01101 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FosP01101 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FosP01101 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FosP01101 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FosP01101 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FosP01101 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FosP01101 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FosP01101 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FosP01101 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FosP01101 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FosP01101 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FosP01101 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FosP01101 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FosP01101 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms