Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abl1P00520 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abl1P00520 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Abl1P00520 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abl1P00520 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abl1P00520 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abl1P00520 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abl1P00520 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abl1P00520 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abl1P00520 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abl1P00520 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Abl1P00520 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Abl1P00520 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Abl1P00520 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abl1P00520 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abl1P00520 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abl1P00520 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Abl1P00520 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Abl1P00520 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abl1P00520 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms