Protein–RNA interactions for Protein: O89113

Ier5, Immediate early response gene 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5O89113 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ier5O89113 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ier5O89113 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ier5O89113 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ier5O89113 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Ier5O89113 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ier5O89113 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ier5O89113 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ier5O89113 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ier5O89113 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ier5O89113 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ier5O89113 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ier5O89113 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ier5O89113 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ier5O89113 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ier5O89113 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ier5O89113 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ier5O89113 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ier5O89113 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ier5O89113 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ier5O89113 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ier5O89113 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ier5O89113 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ier5O89113 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ier5O89113 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ier5O89113 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ier5O89113 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ier5O89113 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ier5O89113 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ier5O89113 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ier5O89113 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ier5O89113 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ier5O89113 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ier5O89113 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ier5O89113 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ier5O89113 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ier5O89113 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ier5O89113 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ier5O89113 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ier5O89113 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ier5O89113 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ier5O89113 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ier5O89113 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ier5O89113 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ier5O89113 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms