Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sypl2O89104 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sypl2O89104 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sypl2O89104 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sypl2O89104 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms