Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc6O88978 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc6O88978 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc6O88978 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms