Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ShdO88834 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ShdO88834 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ShdO88834 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ShdO88834 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ShdO88834 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ShdO88834 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ShdO88834 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ShdO88834 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ShdO88834 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ShdO88834 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ShdO88834 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ShdO88834 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ShdO88834 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ShdO88834 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ShdO88834 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ShdO88834 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ShdO88834 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ShdO88834 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ShdO88834 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ShdO88834 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ShdO88834 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ShdO88834 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ShdO88834 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ShdO88834 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ShdO88834 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ShdO88834 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ShdO88834 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ShdO88834 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ShdO88834 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ShdO88834 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ShdO88834 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ShdO88834 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ShdO88834 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ShdO88834 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ShdO88834 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ShdO88834 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ShdO88834 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ShdO88834 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ShdO88834 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ShdO88834 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ShdO88834 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ShdO88834 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ShdO88834 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ShdO88834 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ShdO88834 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ShdO88834 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ShdO88834 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ShdO88834 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ShdO88834 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ShdO88834 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ShdO88834 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ShdO88834 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ShdO88834 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ShdO88834 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ShdO88834 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ShdO88834 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ShdO88834 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ShdO88834 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ShdO88834 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ShdO88834 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ShdO88834 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ShdO88834 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ShdO88834 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ShdO88834 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ShdO88834 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ShdO88834 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ShdO88834 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ShdO88834 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ShdO88834 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ShdO88834 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ShdO88834 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ShdO88834 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ShdO88834 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ShdO88834 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ShdO88834 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ShdO88834 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ShdO88834 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ShdO88834 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ShdO88834 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ShdO88834 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ShdO88834 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ShdO88834 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ShdO88834 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ShdO88834 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ShdO88834 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ShdO88834 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ShdO88834 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ShdO88834 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ShdO88834 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ShdO88834 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ShdO88834 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ShdO88834 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ShdO88834 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ShdO88834 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ShdO88834 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ShdO88834 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ShdO88834 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms