Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp2O88623 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp2O88623 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp2O88623 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp2O88623 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp2O88623 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp2O88623 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp2O88623 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp2O88623 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp2O88623 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp2O88623 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp2O88623 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp2O88623 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp2O88623 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp2O88623 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp2O88623 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp2O88623 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp2O88623 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp2O88623 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp2O88623 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms