Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnmt3aO88508 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnmt3aO88508 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnmt3aO88508 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnmt3aO88508 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms