Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AvilO88398 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AvilO88398 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AvilO88398 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AvilO88398 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AvilO88398 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AvilO88398 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AvilO88398 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AvilO88398 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AvilO88398 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AvilO88398 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AvilO88398 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AvilO88398 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AvilO88398 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AvilO88398 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AvilO88398 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AvilO88398 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AvilO88398 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AvilO88398 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AvilO88398 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AvilO88398 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AvilO88398 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AvilO88398 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AvilO88398 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AvilO88398 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AvilO88398 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AvilO88398 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AvilO88398 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AvilO88398 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AvilO88398 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AvilO88398 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AvilO88398 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AvilO88398 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AvilO88398 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AvilO88398 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AvilO88398 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AvilO88398 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AvilO88398 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AvilO88398 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AvilO88398 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AvilO88398 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AvilO88398 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AvilO88398 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AvilO88398 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AvilO88398 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AvilO88398 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AvilO88398 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AvilO88398 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AvilO88398 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AvilO88398 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AvilO88398 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AvilO88398 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AvilO88398 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AvilO88398 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AvilO88398 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AvilO88398 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AvilO88398 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AvilO88398 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AvilO88398 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AvilO88398 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AvilO88398 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AvilO88398 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AvilO88398 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AvilO88398 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AvilO88398 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AvilO88398 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AvilO88398 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AvilO88398 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AvilO88398 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AvilO88398 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AvilO88398 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AvilO88398 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AvilO88398 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AvilO88398 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AvilO88398 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AvilO88398 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AvilO88398 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AvilO88398 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AvilO88398 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AvilO88398 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AvilO88398 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AvilO88398 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AvilO88398 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AvilO88398 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AvilO88398 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AvilO88398 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AvilO88398 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AvilO88398 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AvilO88398 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AvilO88398 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AvilO88398 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms