Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp8O70404 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp8O70404 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms