Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox6O70238 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox6O70238 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox6O70238 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox6O70238 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox6O70238 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox6O70238 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox6O70238 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox6O70238 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhox6O70238 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox6O70238 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms