Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sap18O55128 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sap18O55128 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sap18O55128 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sap18O55128 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sap18O55128 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sap18O55128 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sap18O55128 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap18O55128 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap18O55128 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap18O55128 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap18O55128 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sap18O55128 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap18O55128 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap18O55128 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sap18O55128 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap18O55128 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sap18O55128 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sap18O55128 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sap18O55128 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sap18O55128 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sap18O55128 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sap18O55128 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sap18O55128 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sap18O55128 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sap18O55128 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap18O55128 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sap18O55128 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap18O55128 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sap18O55128 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap18O55128 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sap18O55128 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap18O55128 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap18O55128 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap18O55128 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap18O55128 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap18O55128 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sap18O55128 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap18O55128 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sap18O55128 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms