Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg2O55111 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dsg2O55111 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dsg2O55111 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms