Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bnc1O35914 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnc1O35914 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bnc1O35914 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms