Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Flot1O08917 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Flot1O08917 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Flot1O08917 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Flot1O08917 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Flot1O08917 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Flot1O08917 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Flot1O08917 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Flot1O08917 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flot1O08917 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flot1O08917 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Flot1O08917 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Flot1O08917 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Flot1O08917 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Flot1O08917 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Flot1O08917 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Flot1O08917 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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