Protein–RNA interactions for Protein: O08852

Pkd1, Polycystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 4,293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1O08852 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkd1O08852 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkd1O08852 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkd1O08852 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkd1O08852 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkd1O08852 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkd1O08852 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pkd1O08852 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms