Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3aO08759 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ube3aO08759 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ube3aO08759 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3aO08759 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms